一键式轨道生成脚本
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FCH(Q-Chem)
- 在FCH文件夹下的文件中,查高强度峰对应的是哪个轨道
bardata_beta.XAS(闭壳层情况下);bardata.XAS(开壳层情况) - 在GS文件夹内运行
Multiwfn XXX.fchk ➡ 200 ➡ 3 ➡ 输入轨道号(如519-530) ➡ 2 ➡ 1 -
vmd
- shell下: orb 519 ➡ obiso 0.02
- 本地电脑:拷贝XXX.cube到本地电脑
在cube文件夹下,shift+右键 ➡ Powershell
vmd ➡ orb 519 ➡ obiso 0.02 摆好位置
vmd操作:Graphics ➡ colors ➡ element ➡
Graphics ➡ colors ➡ Prepre..➡ CPK ➡ Coloring Method ➡ Element
Graphics ➡ colors ➡ Prepre..➡ isosurface ➡ coborID ➡ 改颜色
File ➡ save visuali.. ➡ orbnumb (保存的文件名称)
将orbnumb拷贝到集群cub所在的位置 ➡ cub2bmp(对所有cub以orbnumb为模板进行渲染)
- 在FCH文件夹下的文件中,查高强度峰对应的是哪个轨道
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Z+1
- gzip -d XXX.gz
- Multiwfn XXX.fch
- 同FCH
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TDDFT(Q-Chem)
- 在XAS.analyze下,拷贝GS/XXX.fchk ➡ XAS.fchk
- Muttiwfn XAS.fchk ➡ 18 ➡ 6 ➡ 回车 ➡(在XAS.data内找高强度峰对应的轨道,如轨道30) ➡ 2 ➡ S30.fch ➡ 退出
- Muttiwfn S30.fch ➡ 0 (看轨道) ➡ 找HOMO/LUMO, 即找2/0,如485(hoLe),486(part) ➡ 退出
- Muttiwfn S30.fch ➡ 200 ➡ 3 ➡ 485-486 ➡ 2 ➡ 退出
- 将orbnumb拷贝到集群cub所在的位置 ➡ cub2bmp(对所有cub以orbnumb为模板进行渲染)