article cover

叫个啥名字的小破站--本站介绍 置顶 生活

2020.2 Start. 1.愿望实现 二月,您好!非典型肺炎已经一段时间了,这期间炸出了很多妖魔鬼怪。春已如约而至,我坚信世界依旧美好。 早在很久之前想建立一个属于自己的网站,无奈并非it专业出身,没有那么多时间,这个愿望始终无法实现。今天,不用种土豆,土豆小王子有时间,哈哈。今天完成了很久以来的一个愿望,纪念一下第一个网站建立的环境。 2021.3...
wangsy 发布于 

X-Ray Spectrum Plotter 用户手册 linux

X-Ray Spectrum Plotter 是一款专为处理和可视化 X 射线光谱设计的 Python 工具,具备双区间展宽、自动批处理、2D 堆叠图与 3D 演化图、实验谱对比等功能,支持混合展宽、3D 去噪、丰富自定义与高分辨率输出,帮助科研人员快速获得清晰直观的谱图分析。
wangsy 发布于 

Inkscape 原位缩放工具-SVGScaler.py使用手册 linux

Inkscape 原位缩放工具通过逐对象以几何中心缩放,确保放大/缩小时位置不动,支持路径、矩形、圆、文本、FlowRoot、图片等,按图层或全局处理,正数放大、负数取倒数缩小,群组时可按整体缩放,输出新文件并可确认覆盖。
wangsy 发布于 

Q-chem 安装指南 (Linux 集群) linux

[该文章已加密,请点击标题输入密码访问]
wangsy 发布于 

用于自动提取芯轨道(分子和原子轨道)的程序 密度泛函

这是一个自动化的后处理工具 extract_orbital_composition.py,能从 .fchk 文件提取指定原子在占据分子轨道中的成分,自动调用 Multiwfn 进行分析,必要时通过 MOKIT 实现 PM 局域化,并输出格式化表格或缓存文件,支持多种输出模式和高级控制选项。
wangsy 发布于 

用于批量生成Q-Chem计算X-ray的程序 密度泛函

qchem_xray.py 是一款自动化生成 Q-Chem XAS/XES 输入的 Python 工具:从 input.ini 获取设置、从 XYZ 提取结构、输出输入文件并自动建立分计算目录,处理 GS 与激发态依赖,结合缓存和 extract_orbital_composition 自动定位芯轨道,支持 GS、FCH、FCH_R、LUMO、TD_XAS、...
wangsy 发布于 

一键式轨道生成脚本 linux

本文提供一个从高强度XAS峰归属到可视化呈现的端到端Q-Chem工作流:在FCH、Z+1、TDDFT分支中,借助bardata、Multiwfn、VMD及cube文件处理,完成峰位-轨道映射、导出并在集群上通过cub2bmp统一渲染成直观的分子轨道可视化图,便于闭壳/开壳态及激发态分析的高效开展。
zhangjr 发布于 

在Windows上使用ORCA计算旋轨耦合(SOC)矩阵元 理论化学

本教程面向无Linux经验的本科生/研究生,教你在Windows上使用 ORCA 直接计算旋轨耦合矩阵元并解析输出;通过甲醛、Ir(ppy)3、石墨烯量子点等实例,系统讲解 SOMF 与标量相对论(ZORA/DKH)的处理、输入文件准备与结果提取,帮助打通理论与实验壁垒,快速获得可用于磷光与自旋翻转过程的 SOC 数据。
wangsy 发布于 

X射线光谱的理论模拟(芯激发态光谱模拟) 理论化学

[该文章已加密,请点击标题输入密码访问]
wangsy 发布于 

utixspec软件包

Utility X-ray Spectroscopy(实用的X射线光谱学工具) 博士在读期间编写的一系列与X射线光谱模拟相关的脚本,以及一些后处理程序。流程图如下:   2024.10 Update. 在家闲来无事,使用python语言扩展了ORCA 6.0 版本的X-Ray的后处理X射线光谱程序。自此,芯激发态的模拟基本不会存在收敛性问题。 ...
wangsy 发布于