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OpenMolcas输出的molden格式问题

叫个啥名字 发布于 阅读:580 科研软件


1.OpenMolcas输出的molden是球谐型基函数,但并不是标准的molden格式,可以使用molden2aim将其转化为标准的molden格式。molden2aim配置需要设置m2a.ini中program=6(表示输入的是openmolcas输出的molden),carsph=1(转为标准球谐基函数),设置为0表示转为笛卡尔型基函数。

2.虽然OpenMolcas生成的molden不是标准球谐基函数的molden格式文件,但是测试可以使用gabeditMultiwfnpegamoid打开,gabedit中对应的d轨道成分:xy是dxy, yz是dyz, xz是dxz, z^2是dz^2, x^2是dx2-y2。

3.molpro输出的molden是笛卡尔型基函数,如果使用gabedit看d轨道需要转换为球谐型基函数,不转换为球谐基函数看到的将是xx, yy, zz, x^2, y^2, z^2。直接使用Chemissian看molpro的轨道,将自动转换为球谐型基函数显示。

4.这里提供几个例子查看molden.zip。m.molden是openmolcas生成的非标准化球谐型molden,m_M是Multiwfn转换的球坐标型molden格式,m_C.molden是molden2aim转换的标准笛卡尔molden,m_S.molden是molden2aim转换的标准球谐型molden。可以分别用gabedit与Chemissian或者Multiwfn查看区别。轨道系数截图在下面给出,看不清楚可以直接下载

5.如果使用Chemissian看molcas的molden,需要转为笛卡尔molden,然后读取时选取类型为molpro产生的molden。

Snipaste_2022-09-19_21-40-48.png

OpenMolcas

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